İYİ Parti'de istifaların başlangıcı, Eskişehir Milletvekili İdris Nebi Hatipoğlu'nun 2 Kasım 2023 tarihinde partisinden istifa ederek AK Parti'ye geçmesi oldu. Hatipoğlu, AK Parti tarafından Eskişehir Belediye Başkan Adayı olarak aday gösterildi.
İhlas Haber Ajansı'nda yer alan habere göre; Ankara Milletvekili Adnan Beker, parti içindeki ikinci istifayı 16 Kasım'da duyurdu. Üçüncü istifa ise İYİ Parti'nin 28. Dönem İstanbul Milletvekili ve Kurucular Kurulu Üyesi Ayşe Sibel Yanıkömeroğlu'ndan geldi. Yanıkömeroğlu, partisinin amaç ve ilkelerinden uzaklaştığını belirterek 6 Aralık'ta istifasını açıkladı.
15 Aralık'ta İYİ Parti İstanbul Milletvekili Salim Ensarioğlu, partisinden istifa ettiğini duyurdu. Son olarak, 21 Aralık'ta İYİ Parti Ankara Milletvekili Yüksel Arslan da istifasını açıkladı.
Bu süreçte, 5 Aralık 2023'te İYİ Parti Sakarya Milletvekili Ümit Dikbayır, partisinden ihraç edildi. Bu gelişmeler sonucunda İYİ Parti'nin Meclis'teki milletvekili sayısı 38'e düştü.